Museum Mpu Tantular Surabaya berdiri di Jl. Taman Mayangkara No. 6 Surabaya. Lokasi yang sangat strategis, karena antara Jalan Raya Darmo dan Jalan Diponegoro dan Museum Mpu Tantular terletak di depan Kebun Binatang Surabaya.
Bangunan utama dari museum ini digunakan untuk gedung exibition. Bangunan barat digunakan untuk laboratorium konservasi dan ruang exibition.